Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms