Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PMS2P3Q13401 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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