Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RPA4Q13156 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RPA4Q13156 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RPA4Q13156 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RPA4Q13156 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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