Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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TRAF1Q13077 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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TRAF1Q13077 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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TRAF1Q13077 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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TRAF1Q13077 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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