Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
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