Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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