Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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