Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FPGSQ05932 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms