Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms