Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHDQ02161 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHDQ02161 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHDQ02161 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHDQ02161 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHDQ02161 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHDQ02161 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHDQ02161 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHDQ02161 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHDQ02161 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHDQ02161 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHDQ02161 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHDQ02161 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHDQ02161 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHDQ02161 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHDQ02161 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms