Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms