Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERFP50548 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERFP50548 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms