Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms