Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX1P48742 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX1P48742 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX1P48742 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX1P48742 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX1P48742 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX1P48742 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms