Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NMUP48645 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NMUP48645 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms