Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRXP46100 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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