Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF2P35227 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF2P35227 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF2P35227 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF2P35227 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF2P35227 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF2P35227 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF2P35227 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF2P35227 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF2P35227 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF2P35227 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF2P35227 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF2P35227 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF2P35227 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF2P35227 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF2P35227 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms