Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms