Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms