Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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