Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KB1P23443 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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