Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TPRP12270 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TPRP12270 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TPRP12270 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TPRP12270 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TPRP12270 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TPRP12270 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TPRP12270 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TPRP12270 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TPRP12270 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TPRP12270 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TPRP12270 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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