Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms