Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATE1O95260 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATE1O95260 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATE1O95260 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATE1O95260 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATE1O95260 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATE1O95260 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATE1O95260 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms