Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA10O75578 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA10O75578 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA10O75578 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA10O75578 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA10O75578 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA10O75578 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA10O75578 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA10O75578 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA10O75578 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA10O75578 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA10O75578 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms