Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTDSP2O14595 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms