Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms