Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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