Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms