Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms