Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms