Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms