Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms