Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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