Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms