Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS2Q9BVG9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS2Q9BVG9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS2Q9BVG9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS2Q9BVG9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS2Q9BVG9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS2Q9BVG9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS2Q9BVG9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS2Q9BVG9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS2Q9BVG9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS2Q9BVG9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS2Q9BVG9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms