Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms