Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms