Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRIMPOLQ96LW4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRIMPOLQ96LW4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms