Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms