Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms