Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms