Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L3Q6VB84 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms