Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms