Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms