Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETM2Q2VYF4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms