Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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