Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CYTH1Q15438 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CYTH1Q15438 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CYTH1Q15438 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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CYTH1Q15438 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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