Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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NR1D2Q14995 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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NR1D2Q14995 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NR1D2Q14995 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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