Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNB1Q14721 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms